Prensip debaz seleksyon peptide antijèn
Otank posib sou sifas pwoteyin lan
Asire w ke sekans sa a pa fòme -helis
N,C Peptides nan pwent yo pi bon pase peptides nan mitan
Evite repete oswa sekans ki toupre repete nan pwoteyin nan
Evite peptides ak omoloji fò
Kwa-lyezon ka fèt nan N, C Nan tou de bout, seleksyon an baze sou lefèt ke kwa-lyezon an se nan fen ki mwens enpòtan pou pwodiksyon an nan antikò.
Pa ka gen twòp nan sekans Pro a, Men, gen youn oswa de Pro Li gen avantaj ke li ka fè estrikti nan chèn peptide relativman ki estab, ki se benefisye nan pwodiksyon an nan antikò espesifik.
Yo nan lòd yo reyalize pi bon rezilta yo nan pwodwi antikò, li nesesè ak anpil atansyon konsepsyon peptide antijèn an.
Konsepsyon an ta dwe satisfè yon kondisyon debaz: Pandan pwosesis vaksinasyon an, antijèn an pa pral pwodwi yon repons iminitè twòp, men an menm tan an, li ka pwodwi antikò ak kapasite nan mare nan pwoteyin nan enterè yo.
Malgre ke konsepsyon antijèn se yon sijè trè konplèks ak anpil detay ki bezwen peye atansyon sou, ki baze sou eksperyans akimile nou an, gen plizyè prensip kle konsepsyon debaz ki ka bay pou referans ou.:
1, Detèmine objektif antikò a
Lè w kòmanse yon nouvo pwojè rechèch, li nesesè pou klarifye kèk pwopriyete debaz nan pwoteyin ki enterese a, sitou si konnen estrikti pwoteyin nan pral yon gwo èd nan chwazi rejyon rekonesans ke antikò a ka fasilman jwenn aksè ak rekonèt. Sepandan, nan absans enfòmasyon estriktirèl egzak sa yo (ki se sitou ka a), konprann objektif etid la afekte estrateji pou konsepsyon peptide. Pou egzanp: Si konsantre rechèch la se sou diferan rejyon nan pwoteyin nan, egzanp C tèminal oswa N fen, oswa pwoteyin nan nan yon eta espesifik, tankou fosforilasyon, elatriye, Lè sa a, polipeptid ki fèt dapre sekans ki nesesè yo ak antikò ki koresponn lan pwodwi pa ta dwe gen anpil difikilte nan aplikasyon an. Sepandan, konfòmasyon pwoteyin lan pral afekte entèraksyon ant antikò a ak rejyon rekonesans li yo. Yon pwoblèm posib nan sitiyasyon sa a se ke si nan pwoteyin ki plwaye rejyon an rekonesans kache andedan pwoteyin nan, antikò a pa pral kapab jwenn aksè nan rejyon sa a. (Pa ka kominike).
2, prensip seleksyon zòn idantifikasyon
Anjeneral pale, rejyon an rekonesans antijenik ki pi ideyal yo ta dwe idrofil, ki chita sou sifas pwoteyin lan, ak estriktirèl deformable. Paske nan pifò anviwònman natirèl, rejyon idrofil yo gen tandans konsantre sou sifas pwoteyin, pandan y ap rejyon idrofob yo souvan vlope andedan pwoteyin nan. Pou menm rezon an, antikò ka sèlman kominike avèk rejyon rekonesans yo jwenn sou sifas pwoteyin lan. Lè rejyon rekonesans sa yo gen ase deformabilite estriktirèl pou avanse pou pi nan pozisyon kote antikò a ka kontakte, yo pral gen yon gwo afinite ak antikò a.
3, zòn rekonesans kontinyèl ak discontinuous
Yon rejyon kontinyèl refere a yon rejyon rekonesans ki konpoze de sekans kontinyèl asid amine. Pifò antikò yo dirije kont rejyon rekonesans kontinyèl yo. Kapasite antikò yo mare nan rejyon sa yo ak gwo afinite endike ke sekans sa a pa nan pwoteyin nan. Rejyon rekonesans discontinuous la reprezante yon sekans polipèptid ki gen yon sèten pli, oswa rejyon rekonesans yon antikò ki konekte de polipèptid separe ansanm. Nan kèk ka, yo ka pwodui antikò kont rejyon rekonesans discontinuous sa yo, men polipèptid antijèn yo itilize pou vaksinasyon an dwe gen yon estrikti segondè ki sanble ak rejyon rekonesans discontinuous la, epi longè sekans lan bezwen satisfè kondisyon ki enpòtan yo.
4, Konsèy debaz
Pou evite risk pou rejyon rekonesans la kache andedan pwoteyin nan, anjeneral nou rekòmande pou w chwazi yon antikò N, C korespondan ki pwodui nan tou de bout. Paske nan pwoteyin entak, N, C Tou de bout yo anjeneral ekspoze sou sifas pwoteyin lan. Sepandan, li enpòtan sonje ke pwoteyin manbràn C fen a twò idrofob epi li pa apwopriye kòm yon antijèn.
5, longè sekans
Anjeneral, nou rekòmande pou longè sekans polipèptid antijèn an ant 8-20 rezidi asid amine. Si li twò kout, gen yon risk ke peptide a pral twò espesyal ak afinite a (kapasite obligatwa) ant antikò ki pwodui ak pwoteyin natirèl la pa pral ase fò. Menm jan an tou, si longè sekans lan depase 20, li posib pou prezante estrikti segondè ak antikò yo pwodui ka pèdi espesifik. Anplis, pi long chèn peptide a, se pi difisil pou fè sentèz, sa ki fè li difisil pou jwenn pwodwi pite segondè.
6, Chwa transpòtè pwoteyin kwa-ki lye
Prensip debaz: Ajoute pwoteyin transpòtè a nan fen a byen lwen rejyon an rekonesans antikò, ki pa enkli nan sekans lan. Cys Nan ka N oswa C fen plis Cys Metòd pi pito pou cross-linking.
7, Lojisyèl analiz souvan itilize
MacVecfor TM; DAN star TM; PC-Gene TM